اسپرماتوسل خود به خود از بین نمی‌رود ولی اکثر آنها نیاز به درمان ندارند و معاینه ی دوره‌ای برای بررسی وضعیت کیست به بیمار توصیه می‌گردد. در صورتی که کیست خیلی بزرگ شود و با درد همراه باشد به درمان نیاز دارد. متاسفانه برای درمان این عارضه دارویی اختصاصی وجود ندارد و دارو‌های خوراکی تجویز شده صرفه جهت کاهش التهاب و درد خواهند بود.

عمل جراحی اسپرماتوسلکتومی، با هدف خارج کردن کیست از اپیدیدیم و حفظ عملکرد طبیعی دستگاه تناسلی به عنوان درمان اصلی این عارضه شناخته می‌شود. در برخی موارد پزشک مجبور است علاوه‌ بر کیست، بخشی و یا همه اپیدیدیم را نیز خارج کند. البته مجددا لازم به ذکر است که اغلب موارد اسپرماتوسل نیاز به درمان ندارند و فقط در صورتی که در و یا تورم برای بیمار بسیار ناراحت کننده باشد به گونه ای که خود بیمار جراحی را ترجیح بدهد جراحی لازم است.